2199年，星际舰队开拓者们构建的地球网络护卫体系开始蔓延宇宙各处，人类进入虚实转换的太空时代，女主因父母在星际边缘基地恐怖袭击中丧命，回到地球网中的太空训练学院，结识了各种地球人、变异人、改造人以及阿达克隆人、扎塔外星人等类人生命学员，逐渐发现多艘太空战舰或爆炸、或消失，女主逐渐觉醒打开星际传送门超能力、找到钥匙打开了2047年星际迁徙计划时期的冰封魔盒，回忆起百多年前暗杀反星际移民计划奸商领袖事件，面临成为救世之主与毁灭化身的艰难选择，这也是她成为《我的漂亮老师2》代号的存在使命！学员们想成为星舰指挥官，财团们要争权夺利、收拢超能力人才，刚停战的外星人监视和套取《我的漂亮老师2》情报，克隆人们反抗探索者首领的压榨，财团创始人女儿监禁女主套取得到光门传送能力，学员和教授们阶段性胜利，女主意外发现奴隶故人们。